影響錯流過濾的主要因素有：過濾的液體，過濾介質，濾室的幾何形狀，反沖洗。

影響錯流過濾的主要因素有：較高的流速、壓力及溫度能使流量得到提高；較小的過濾溝道同樣能提高流量。

影響錯流過濾的主要因素有：高分子溶質的存在，使流量降低，例如過濾牛奶時就是如此。在無反沖洗的情況下，微孔膜的流量是連續降低的。而半透膜的流量降，要比微孔介質的慢得多；其原因就在于半透膜不出現孔隙堵塞；這說明用微孔介質代替超濾膜式無益的。在某些情況下，反沖洗給微孔介質帶來了較高的穩定流量。使用孔隙較大的稀疏微孔介質，未必能獲得較高的流量。其初始流量雖然較高，但隨后便因介質堵塞而迅速降低。同傳統的終端過濾相比，錯流過濾是非常有利的。例如，在同樣條件下，終端過濾的濾液流量在幾分鐘之內即降至零，而采用錯流過濾卻能獲得近乎恒定的流量；錯流過濾對給料濃度的變化不敏感，因而能在不作預處理的情況下成功地過濾臟污液體。