節能凈化空調直通式:系統處理的空氣全部來自室外，經過處理后送入室內，然后全部排出室外。這種系統模式耗冷量和熱量大，工程投資和運行費用高。當潔凈室排放大量有害氣體，無法解決局部排風時，采用這種模式。

節能凈化空調封閉式:該系統處理的空氣全部來自空調房間本身，循環往復。當潔凈室長時間無人停留，僅用于儲存或保證精密儀器正常運行，或一些不需要外界新鮮空氣的特殊場合，可采用密閉系統。封閉系統沒有室外新風，系統耗冷量和熱量少，但衛生條件差。

節能凈化空調混合式:該系統不僅吸收部分室外新風，還利用部分回風。根據回風的形式，有一次回風系統和二次回風系統。該系統不僅能滿足衛生要求，而且經濟合理，應用廣泛。